Inhoudsopgave:

Hoe analyseer je SNP?
Hoe analyseer je SNP?

Video: Hoe analyseer je SNP?

Video: Hoe analyseer je SNP?
Video: High resolution melt analysis for SNP genotyping and mutation detection 2024, November
Anonim

Hoe u uw Single Nucleotide Polymorphism (SNP)-chipgegevens kunt analyseren?

  1. Cluster je SNP's . Sorteer eerst de gegevens op chromosoom en vervolgens op chromosoompositie, om uw SNP's .
  2. Kies welke SNP's nastreven.
  3. Vind je SNPS op het chromosoom.
  4. Identificeer genfuncties.
  5. Graaf dieper.

Ook gevraagd, hoe bepaal je SNP?

Er zijn meerdere methoden om SNP's te detecteren : PCR-AS, PCR-RFLP, TaqMan, mPCR-RETINA, enz. Alle informatie over de benodigde tijd en over de kosten van elk wordt ook op prijs gesteld!

En wat veroorzaakt SNP's? SNP's kan biologische variatie tussen mensen genereren door: veroorzaken verschillen in de recepten voor eiwitten die in genen zijn geschreven. Die verschillen kunnen op hun beurt een verscheidenheid aan eigenschappen beïnvloeden, zoals het uiterlijk, de vatbaarheid voor ziekten of de reactie op medicijnen.

Vervolgens kan men zich ook afvragen, waar wordt SNP-analyse voor gebruikt?

In de moleculaire biologie, SNP array is een type DNA-microarray dat is gewend om polymorfismen binnen een populatie detecteren. Een enkel nucleotide polymorfisme ( SNP ), een variatie op een enkele plaats in het DNA, is het meest voorkomende type variatie in het genoom.

Hoe werken SNP-chips?

Het DNA van het monster wordt geamplificeerd, een marker wordt bevestigd en gehybridiseerd tot de reeks. De array wordt gescand tot kwantificeer de relatieve hoeveelheid monstergebonden tot elke functie. Voor SNP's , is er een paar sondes: één voor elk van de allelen. Voor niet-polymorfe CNV-sondes is er slechts één enkele sonde.

Aanbevolen: