Wat is het verschil tussen 16s-rRNA en 18s-rRNA?
Wat is het verschil tussen 16s-rRNA en 18s-rRNA?

Video: Wat is het verschil tussen 16s-rRNA en 18s-rRNA?

Video: Wat is het verschil tussen 16s-rRNA en 18s-rRNA?
Video: ДНК против РНК (обновлено) 2024, November
Anonim

de belangrijkste verschil tussen analyses uitvoeren met 18S rRNA gengegevens in plaats van 16S-rRNA gengegevens (of ITS-gegevens) is de referentiedatabase die wordt gebruikt voor OTU-picking, de taxonomische toewijzingen en het op sjablonen gebaseerde uitlijningsgebouw, omdat deze eukaryote sequenties moet bevatten.

Waarom wordt het 16s-rRNA-gen, gezien dit, gebruikt voor identificatie?

De 16S ribosomaal RNA-gen codeert voor de RNA-component van de 30S-subeenheid van het bacteriële ribosoom. Vanwege de complexiteit van DNA-DNA-hybridisatie, 16S rRNA-gen sequentiëring is gebruikt als een hulpmiddel om identificeren bacteriën op soortniveau en helpen bij het differentiëren tussen nauw verwante bacteriesoorten [8].

Hebben eukaryoten bovendien 16s-rRNA? De 16S-rRNA gen is aanwezig in alle bacteriën en een verwante vorm komt voor in alle cellen, ook die van eukaryoten.

De vraag is ook, wat is 18s en 28s rRNA?

De 28S / 18S ribosomaal RNA ratio wordt vaak gebruikt om de kwaliteit van totaal RNA te beoordelen dat uit een bepaald monster is gezuiverd. In mensen, 28S rRNA heeft ~ 5070 nucleotiden, en 18S heeft 1869 nucleotiden, wat a. geeft 28S / 18S verhouding van ~ 2,7. een hoge 28S / 18S verhouding is een indicatie dat het gezuiverde RNA intact is en niet is afgebroken.

Wat is 16s rRNA-sequencing?

16S-rRNA gen volgorde analyse is een standaardmethode in bacteriële taxonomie en identificatie, en is gebaseerd op de detectie van volgorde verschillen (polymorfismen) in de hypervariabele regio's van de 16S-rRNA gen dat in alle bacteriën aanwezig is.

Aanbevolen: